液相色谱柱是一种用硅胶制作而成的材料，它是由保护柱，保护柱套，保护柱芯这三部分组成的。在使用液相色谱柱的时候如何让选择，在选择色谱柱之前，先多了解自己的样品和杂质，他们的类型结构、极性、酸碱性、分子量大小等等。再看看样品是极性的且弱酸性的；就可以选择C18在百分之百酸性水溶液条件下检测，即要选择承受百分之百纯水且对极性化合物保留很好的色谱柱。
液相色谱柱的购买一定要注意，如果样品极性太强，或酸性太强；可以选择CN，NH2，或硅胶柱，亲水色谱，也有使用C18+强阴离子对试剂或强阴离子交换色谱柱，缺点是离子对试剂平衡时间长，对流动相pH要求比较精密，否则很难重复实验，另外离子对试剂很难洗下来，基本上用了离子对的色谱柱就不能再用于其它实验。若样品是碱性的，可选择高纯硅胶柱他们都会减少碱性化合物的拖尾，一般会选择中性或偏碱的条件下做，因为这样可增加碱性样品的保留。
